實驗室氣流控制目標是保證實驗室內通風換氣，捕捉和排除有害顆粒，確保操作人員的安全；保持正確的氣流方向，防止污染；保證實驗室內的環境溫度和濕度，降低運行費用，節約能源。
實驗室通風櫥氣流控制由控制器與風閥來完成。由于蝶閥特性具有結構簡單、造價低、運行可靠的優點，但是精度比較低；文丘里閥的閥門壓降在150-750Pa范圍內流量和壓力無關，采用文丘里閥可以將風量控制精確到氣流控制信號的±5％，且閥前閥后無需附加的直風道，閥門有定風量和變風量控制類型，這樣可以滿足實驗室多種控制要求，當控制信號要進行變更時，反應速度十分快速，不到一秒的時間就能進行變更完，風道靜壓變更也是如此，閥門控制相應速度快且準確，因此實驗室氣流控制設計時，通風柜的排風量、房間補風量采用蝶閥或文丘里閥控制。
為了保證通風柜平均面風速恒定在控制點，排風量選擇其控制器來進行控制，控制器會動態顯示實際的面風速，如果排風系統發生故障，還會做出聲光報警，遇到緊急情況，操作人員還可通過控制器面板按鍵強制將排風量變為最大；為了能得到所需的排風量，通風柜的調節門傳感器檢測門高度調節開口大小；為了確保控制每個放間的補風和排風，每個實驗室都會配置一臺房間控制器，這種控制器可以同時檢測出兩臺通風柜的排風量，這樣就可以動態調節房間內的補風和排風情況，確保房間內風量恒定。
