潔凈室設計通常由有資質的設計院完成，但潔凈室承包商負責深化設計以達到潔凈頂板墻板的具體生產規(guī)格要求和實際安裝要求。

深化設計中首先對頂板上的潔凈燈具、送回風口進行調整，原則是布置在一塊整板中間，距板邊至少大于150 mm，與相鄰其它頂板對齊排成一直線。如遇設備穿吊頂板的情況，當然只能避讓，畢竟設備的位置是必須優(yōu)先滿足的。風口及燈具如與消防的噴淋頭、煙感碰撞，應該將相對尺寸較小的噴淋頭、煙感、溫感移位，增加或減少，但必須滿足消防規(guī)范。這樣潔凈室吊頂?shù)恼w美觀性也就達標了。
其次對于潔凈墻板的排版主要在立面圖上體現(xiàn)，信息量較大且體現(xiàn)了較多專業(yè)在墻板上的布置，其中包含了潔凈窗、潔凈門、家具、消火栓箱、聲光手報、側回風口、設備控制面板、門禁面板、開關插座、潔凈室配電箱、等電位箱、網絡接口、設備穿墻、純化水用點、工藝監(jiān)控HMI、EMS、壓差計等，需綜合各專業(yè)的信息來布置墻面以防相互碰撞，影響安裝，并需調節(jié)部分潔凈墻板的尺寸及墻龍骨的位置。
潔凈頂板分為可拆卸頂板及不可拆卸頂板兩種形式，目前市面上的潔凈頂板厚度主要為50 mm，60 mm，100 mm， 標準頂板從上到下主要由5 層材料構成, 分別為：彩鋼板+ 玻鎂板+ 巖棉+ 玻鎂板+ 彩鋼板, 以及頂板內部的相關的龍骨等內部加強部分. 頂板系統(tǒng)的耐火極限為1 小時。目前GMP 藥廠的潔凈室吊頂上技術夾層由于維修的需要通常采用可上人吊頂，承載150 kg/m2。
潔凈墻板也分為可拆卸墻板及不可拆卸墻板兩種形式。可拆卸墻板可分為中空墻，1 h 潔凈防火墻，2 h 潔凈防火墻，3 h潔凈防火墻， 厚度為100 mm 及200 mm。不可拆卸墻板厚度為50 mm 及60 mm。
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