潔凈廠房室內要平整光滑, 不積塵, 不起塵, 易于清掃。因此, 建筑材料的選擇,構造處理必須認真細致。頂棚是多功能的結構物, 不僅為了建筑上的美觀, 還要滿足空調和照明的要求。空調進風口布置要均勻, 間距要適當, 數量要充足, 保證良好的氣流組織。照明要結合室內空間合理布置, 既有現代的美感, 又保證足夠的照度和高度的均勻性。頂棚還要做到撿修不影響生六。

頂棚結構形式大體上可分為三類即現澆鋼筋混凝土板、預制鋼筋混凝土板、輕骨架板材吊頂。其中, 輕骨架板材吊頂應用范圍最廣, 它包括骨架、透光板材、不透光板材。透光板材國內可供選擇的為有機玻璃、鋼化玻璃、夾層安全玻璃不透光板材可選用復合鋼板、電化鋁板、塑科飾面板、玻璃鋼板、不銹鋼板。

墻面可分為板材類和涂料類。除頂棚所述的各種板材外, 還有大理石、水磨石、彩色玻璃、磁磚, 這類材料的缺點是縫隙不好處理。涂料類系指高級油漆或玻璃鋼整體裱湖, 這類材料完整無縫, 效果良好。此外, 各種高檔塑料墻紙也可供選擇。

地面要求平坦光滑, 不起塵, 不積塵, 熱工性能好, 耐磨, 有彈性。根據潔凈要求可選用嵌木地板、高級水磨石、大理石、花崗石、塑料地板、塑料卷材地板、現僥無縫塑料瑪蹄脂。采用剛性地面時, 應在墊層或結合層適當配筋, 使不產生溫度裂縫。墊層施工縫不宜留在房間內, 應留在不同材料交接處或與地面伸縮縫重合。

門窗門的設計應有良好的密封性能和使用方便, 以金屬材料為宜。外門密封為主, 內門使用方便為主, 也得保證密封性能。外門設門斗, 內門只設一道, 只有在有恒壓要求時, 才設門斗, 以利壓力調整。門的開啟方式從有利氣流穩定出發, 最好采用推拉式。窗一般不設置, 如需要設置, 一定要保證嚴格的密閉性能, 從構造上減少接縫,處理好窗框和墻的縫隙。遞物窗是潔凈廠房中的特殊設備, 使零部件或產品在傳遞中不帶進外部塵埃, 常用的有連鎖雙層窗、中軸旋轉窗、通過式洗滌箱。室內設計除上述主要構件外, 還有室內凸凹角、電開關、插頭、配電箱、擴雜餐、屯鐘、排風柵、消防設備等都需要認真加以處理。