實驗室平面布局的設計
實驗室平面布局是實驗室設計的基礎，只有按照功能分區和工作流程的需求做好相應的平面布局規劃才能確保后續的水、電、風等專業的設計，可謂牽一發而動全身。因此平面布局設計階段應盡可能地詳細考慮工作和發展的需求，合理配置空間，盡量優化整合。除了布局的優化和儀器設備的擺放位置的設計外，還應充分考慮到人員流動與物品流動的方向是否符合工作要求。例如，為了避免實驗人員頻繁跑動，前處理室應該和儀器室在同一樓層；氣瓶室應和氣相色譜儀、氣質聯用儀等儀器在同一樓層；盡量讓單層面積最大化，以避免樓層過多，每一層都要設置洗滌室、樣品室以充分利用空間；生物安全室應合理布局潔凈區、半潔凈區、污染區，以避免交叉污染。
實驗室暖通空調設計
暖通空調系統必須滿足實驗室研究要求。除對溫度、濕度需嚴格控制外，需有足夠的通風量處理煙塵、異味、空氣中污物，滿足煙罩通風以及實驗室內熱負荷要求。同時必須充分考慮系統的可靠性并考慮富裕量。不同性質區域需保證不同的相對壓力,并要根據相關標準從長遠上考慮節能。實驗室中間操作罩口NC最大值不宜超過50dB，除非設備本身允許外，NC一般不宜超過60 dB。
實驗室給排水系統應與實驗室模塊相符合，排水系統應設計靈活，并預留部分設施以保證實驗室的可靠和持續運行，盡量避免在實驗室區域做穿墻處理。
污、廢水系統應設置生活污水與生產廢水分流排水管網，生活污水處理達到中水回用標準后備用，再回用于綠化及水景補水。科研生產廢水采取局部處理經消毒后與集中處理相結合的方式。對被毒菌污染廢水及放射性廢水，就近設置失活及衰減 處理裝置，嚴格控制，處理合格后排放。
地面雨水經雨水管道有組織的匯集用流槽卵石層過濾后儲存回用，余量及洪水就近排入明渠。
實驗室集中供氣系統
實驗室的很多設備的運行都需要各種各樣的氣體供應，目前來說以集中供氣作為主流設計方案得到廣泛使用。氣瓶室的安全性必須得到保障，必須采用防爆門、泄爆窗、氣體泄漏感應報警裝置、所有電器電路均應采用防爆型的、還應考慮防雷、防靜電以及空調設備。
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