1. 分區(qū)明確：嚴格劃分為試劑準備區(qū)、樣本制備區(qū)、擴增區(qū)和產物分析區(qū)。每個區(qū)域功能獨立，避免不同操作環(huán)節(jié)之間的交叉污染。例如試劑準備區(qū)專門用于試劑的準備與儲存，需保持潔凈，避免引入核酸模板等污染物；樣本制備區(qū)用于樣本的處理，操作過程中可能產生氣溶膠，應與其他區(qū)域嚴格隔離。
2. 單向流程：設計合理的人流、物流通道，遵循從試劑準備區(qū)→樣本制備區(qū)→擴增區(qū)→產物分析區(qū)的單向工作流程。工作人員和實驗物品按此方向流動，不得逆向返回，防止不同區(qū)域的污染交叉?zhèn)鞑ァ＠鐦颖緩臉颖局苽鋮^(qū)處理后，直接流向擴增區(qū)，避免攜帶擴增產物的樣本回流至樣本制備區(qū)。
3. 緩沖間設置：在不同功能區(qū)之間設置緩沖間，起到過渡和緩沖作用。緩沖間兩側的門不能同時開啟，可有效減少不同區(qū)域間空氣的直接對流，降低污染擴散的可能性。如在樣本制備區(qū)與擴增區(qū)之間的緩沖間，可防止樣本制備過程中產生的氣溶膠進入擴增區(qū)，影響擴增反應。
